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大腸桿菌折戟沉沙,誰來拯救包涵體蛋白?

更新時間:2024-07-16      點(diǎn)擊次數(shù):826

哈嘍寶子們,我最近遇到了一個難纏的蛋白,用大腸桿菌表達(dá)后會出現(xiàn)在沉淀中。如果從沉淀中提取純化,操作復(fù)雜姑且不論,還有可能沒有活性!如果優(yōu)化培養(yǎng)條件讓它在上清中表達(dá),需要慢慢摸索,費(fèi)時費(fèi)力還不一定成功。這幾天為了思考解決辦法,真是要茶飯不思了!

閉門造車不如出門取經(jīng),這不,我在萬能的師兄這里求來了一樣新“法寶",據(jù)說它可以讓包涵體蛋白在上清中表達(dá)。今天讓我們一起來看一下它究竟“威能"如何吧!內(nèi)含我的真實(shí)實(shí)驗(yàn)步驟+結(jié)果+操作Tips哦。


如何拯救包涵體蛋白?


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“法寶"顯威——無細(xì)胞蛋白表達(dá)試劑盒初體驗(yàn)



一、使用前準(zhǔn)備


打開試劑盒,讓我們看一下它的廬山真面目。

試劑盒內(nèi)一共三個組分,分別是:

組分A、組分B、PC(陽性對照質(zhì)粒)。

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將各組分取出,在冰上融化。

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二、模板準(zhǔn)備


與原核細(xì)胞表達(dá)不同,這款無細(xì)胞試劑盒可以不用質(zhì)粒模板,只需要在目的基因上下游引入T7轉(zhuǎn)錄表達(dá)原件,構(gòu)建一個線性模板。

第一步,用PCR分別獲得5UTR片段,3UTR片段以及目的基因片段;

第二步,用重疊PCR方法,將上一步獲得的目的基因片段和5UTR片段,3UTR片段拼接稱完整的線性表達(dá)模板。

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三、體系構(gòu)建


由于是初次嘗試,我這次選擇50μL的總體積。在96孔板中反應(yīng),按照這張表加試劑和構(gòu)建好的DNA模板5μL(體系體積的1/10),用移液槍反復(fù)吹打混勻。


試劑

陰性對照(μL

陽性對照(μL

實(shí)驗(yàn)組(μL

組分A

20.5

20.5

20.5

組分B

16.7

16.7

16.7

DNA模板

/

5

5

雙蒸水

12.8

7.8

7.8

反應(yīng)總體積

50

50

50


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四、孵育


將混合好的反應(yīng)液轉(zhuǎn)移至搖床中,溫度25℃、180rpm,反應(yīng)16h,確保蛋白表達(dá)。


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孵育四小時后,迫不及待先看一下GFP的表達(dá)情況,觀察到陽性對照已有明顯綠色熒光。

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五、收獲


次日一早,打開搖床就看到了陽性對照醒目的綠色熒光。既然陽性對照表達(dá)了,目標(biāo)蛋白想來不成問題!滿懷期待開始離心、跑膠鑒定。


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六、鑒定


將陰性對照和實(shí)驗(yàn)組分別制洗脫樣、上清樣、沉淀樣,上樣量:洗脫樣、上清樣10μL,沉淀樣5μL。電泳條件:12%SDS-PAGE膠,100V,1.5h。

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不愧是師兄力薦的“法寶",沒有辜負(fù)我的厚望,第一次實(shí)驗(yàn),我的蛋白就在上清中成功表達(dá)了!


七、總結(jié)

這次實(shí)驗(yàn)真是一次全新的體驗(yàn)。在無細(xì)胞蛋白表達(dá)體系下,整個實(shí)驗(yàn)從模板構(gòu)建、反應(yīng)體系構(gòu)建、孵育、到最后收獲目標(biāo)蛋白并鑒定,只用了兩天時間,不但在上清中表達(dá)出了原核細(xì)胞表達(dá)中會形成包涵體的蛋白,還大大縮短了實(shí)驗(yàn)時間。真讓我有把所有蛋白都用無細(xì)胞體系表達(dá)的沖動!

Tips:


1.無細(xì)胞蛋白表達(dá)試劑盒可以用線性模板也可以用質(zhì)粒模板,線性模板更加方便快捷,但是質(zhì)粒模板表達(dá)量一般較高。

2.組分A、B在實(shí)驗(yàn)前要提前放在冰上融化,防止試劑失效。使用前先用移液槍吹打混勻,再吸取相應(yīng)體積。

3.微孔板四周可以加入適量雙蒸水,防止孵育過程中體系水分蒸發(fā)。本次實(shí)驗(yàn)因?yàn)橐^夜表達(dá),為了確保反應(yīng)體系不被蒸干,我在96孔板最外側(cè)一周的所有孔位里都加了水,而且在搖床四角也各放置了一只裝水的離心管。

4.對于復(fù)雜蛋白表達(dá),可以延長孵育時間,保證蛋白充分表達(dá)。

5.如果調(diào)整反應(yīng)體積,需要按照說明書推薦隨之調(diào)整反應(yīng)容器。


CFPS——蛋白表達(dá)“新勢力"


初次表達(dá)包涵體大獲成功,無細(xì)胞蛋白表達(dá)究竟是“何方神圣"?在實(shí)驗(yàn)結(jié)束之后,我粗略了解了一下這一新技術(shù),發(fā)現(xiàn)它的強(qiáng)大不止于此。

無細(xì)胞蛋白表達(dá)(Cell-free protein expression,CFPS)是指將細(xì)胞內(nèi)合成蛋白所需要的RNA聚合酶、核糖體及轉(zhuǎn)錄翻譯輔助因子等分子機(jī)器提取出來,并輔以核苷酸、氨基酸、能量物質(zhì)及基因模板,在沒有活細(xì)胞參與的體外直接合成蛋白質(zhì)的生物合成反應(yīng)。

受細(xì)胞自身生理功能限制,有些蛋白在傳統(tǒng)的細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)產(chǎn)量低甚至不能表達(dá),而無細(xì)胞系統(tǒng)可以擺脫這種限制,廣泛適用于細(xì)胞因子、抗體、膜蛋白、毒性蛋白、包涵體蛋白表達(dá)等場景。此外,無細(xì)胞蛋白表達(dá)反應(yīng)周期短、易與自動化設(shè)備結(jié)合、自由度與可控程度高,適合蛋白快速交付、酶定向進(jìn)化篩選、AI蛋白制造、ADC藥物開發(fā)等領(lǐng)域,可謂是蛋白表達(dá)領(lǐng)域的“新勢力"。

隨著合成生物學(xué)發(fā)展,無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)已然嶄露頭角,大有騰飛之勢。技術(shù)的發(fā)展是推動科學(xué)研究進(jìn)步的重要助力,善于利用新技術(shù),有時能使科研過程事半功倍,我也算是深有體會了!



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